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牡蛎和粪便中GⅠ、GⅡ型诺如病毒实时聚合酶链反应检测方法的建立

牡蛎和粪便中GⅠ、GⅡ型诺如病毒实时聚合酶链反应检测方法的建立

作     者:孙亚萍 程民 宋士利 张心会 李蓉 SUN Ya-ping;CHENG Min;SONG Shi-li;ZHANG Xin-hui;LI Rong

作者机构:杭州市余杭区疾病预防控制中心检验科311100 中国疾病预防控制中心营养与食品安全所 

基  金:国家自然科学基金资助项目(30671752) 

出 版 物:《中华流行病学杂志》 (Chinese Journal of Epidemiology)

年 卷 期:2008年第29卷第6期

页      码:594-597页

摘      要:目的 建立适用于牡蛎和粪便中快速、特异、灵敏的GⅠ、GⅡ型诺如病毒(NV)定量分型诊断方法。方法 通过对GⅠ、GⅡ型NV基因组保守序列的比对分析,设计高度特异的引物和探针,建立以TaqMan探针为基础的实时聚合酶链反应方法(TaqMan Real—time RT—PCR)。结果 该方法对NV核酸检测高度特异,且GI和GⅡ型之间无交叉反应,最低检出限达10^2 copies/ul。对90份新鲜牡蛎样品和37份腹泻粪便标本分别用常规RT—PCR和笔者建立的TaqManReal—time RT—PCR进行NV检测,发现牡蛎样品中后者的检出率明显高于前者,而粪便标本中两者无明显差别。同时对阳性标本的测序分析证实结果准确可靠。结论 研究中建立的TaqMan Real—time RT—PCR方法可用于海产品标本及粪便中NV定量及分型检测,可作为应对NV胃肠炎暴发的有效诊断方法。

主 题 词:实时聚合酶链反应 诺如病毒 基因型 

学科分类:1004[医学-公共卫生预防医学类] 1002[医学-临床医学类] 1010[医学-医学技术类] 100215[100215] 100403[100403] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:0254-6450.2008.06.019

馆 藏 号:203142437...

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