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牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析

牛病毒性腹泻病毒基因Ⅱ型HLJ-10分离株全基因组克隆及其序列特征分析

作     者:刘华 付培芬 李岩 温凯 贾莹 刘晓玫 张海丽 商云鹏 高明春 马波 张文龙 王君伟 LIU Hua;FU Pei-fen;LI Yan;WEN Kai;JIA Ying;LIU Xiao-mei;ZHAGN Hai-li;SHANG Yun-peng;GAO Ming-chun;MA Bo;ZHANG Wen-long;WANG Jun-wei

作者机构:东北农业大学动物医学院黑龙江哈尔滨150030 

基  金:现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-37) 

出 版 物:《中国预防兽医学报》 (Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine)

年 卷 期:2012年第34卷第1期

页      码:24-27页

摘      要:为研究牛病毒性腹泻病毒(BVDV)的分子特征,本研究参考GenBank中登录的BVDV基因Ⅱ型病毒株全基因组序列,设计多对引物,通过RT-PCR方法,对一株分离自某商品化血清中的BVDV分离株HLJ-10全基因组进行分段克隆及序列测定,获得了该分离株的全基因组序列。生物信息学分析表明,该分离株为BVDV基因Ⅱ型,全长12 284 nt,编码区为11 694 nt,共编码3 897个氨基酸,5 和3 非编码区分别为385 nt和205 nt。与其它BVDV参考株序列比对分析表明,HLJ-10与SH-28和KZ91CP进化关系较密切,预测该分离株含有22个潜在糖基化位点,氨基酸差异性分析表明E2蛋白的氨基酸序列在瘟病毒属中变异性较大。

主 题 词:牛病毒性腹泻病毒 基因组 序列分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1008-0589.2012.01.06

馆 藏 号:203143451...

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