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麻疹病毒属病毒种特异性探针的设计

麻疹病毒属病毒种特异性探针的设计

作     者:朱晓光 刘冰 李斌 孙远 付玉 杨松涛 高玉伟 王铁成 夏咸柱 王承宇 ZHU Xiao-guang;LIU Bing;LI Bin;SUN Yuan;FU Yu;YANG Song-tao;GAO Yu-wei;WANG Tie-cheng;XIA Xian-zhu;WANG Cheng-yu

作者机构:军事医学科学院军事兽医研究所长春130062 

基  金:军队医药卫生科研基金06G138 

出 版 物:《中国生物制品学杂志》 (Chinese Journal of Biologicals)

年 卷 期:2010年第23卷第10期

页      码:1132-1134页

摘      要:目的设计能检测麻疹病毒、犬瘟热病毒、牛瘟病毒、海豹瘟热病毒、海豚瘟热病毒和小反刍兽疫病毒的基因芯片探针,制备芯片用于以上病毒的种特异性检测。方法在ncbi网站下载上述病毒全部基因组序列信息,利用生物学软件CLUSTAL W对从GenBank中获得的6种病毒所有序列进行比对,获得每种病毒有意义的特异序列,以此作为设计oligo探针的备选序列,利用生物软件Primer Premier 5.0设计探针。选择最优化探针,制备基因芯片,并进行特异性验证。结果获得6条长度均一,退火温度相近,特异性良好的种特异性寡核苷酸探针。结论利用GenBank数据库和生物学软件Primer Premier 5.0设计病毒检测基因芯片探针,是一种快速、有效的方法。

主 题 词:麻疹病毒属 种特异性 探针 基因芯片 

学科分类:07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 090102[090102] 0710[理学-生物科学类] 0831[工学-公安技术类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 0703[理学-化学类] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.13200/j.cjb.2010.10.103.zhuxg.014

馆 藏 号:203144074...

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