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猪圆环病毒1型和2型四川分离株全基因克隆分析

猪圆环病毒1型和2型四川分离株全基因克隆分析

作     者:朱玲 郭万柱 徐志文 陈杨 周远成 ZHU Ling;GUO Wan-zhu;XU Zhi-wen;CHEN Yang;ZHOU Yuan-cheng

作者机构:四川农业大学动物科技学院四川雅安625014 

基  金:四川省科技厅生物技术专项 四川省教育厅重点专项(2004D004) 

出 版 物:《四川农业大学学报》 (Journal of Sichuan Agricultural University)

年 卷 期:2007年第25卷第2期

页      码:127-130页

摘      要:参照Genbank收录猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)1、2型序列,设计两对特异性引物,分别扩增猪圆环病毒1型和2型四川分离株(PCV1-YA1株和PCV2-SC株)全基因组,获得了预期目标大小一致扩增产物,分别将其克隆于PMD18-T载体,分别命名为PMD18-T-PCV1-YA与PMD18-T-PCV2-SC。经酶切鉴定和序列测定证实,成功克隆了PCV1-YA1株1759bp和PCV2-SC株1767 bp的全基因组序列。所得序列与GenBank中的国内外其它PCV1和PCV2毒株进行比较分析,其同源性分别达到98.8%-99.9%与93.6%-98.6%;而PCV1-YA1株和PCV2-SC株之间的同源性则仅为69.2%,进一步分析两个毒株的主要阅读框架,毒株间ORF1核苷酸序列及推导的氨基酸同源性均为85.3%,而ORF2的核苷酸序列及推导的氨基酸同源性分别为66%和65.2%。推导显示两毒株之间ORF1编码产物疏水性区域分布有相似之处,而ORF2编码产物的跨膜区存在差异。

主 题 词:猪圆环病毒 全基因 克隆 序列分析 

学科分类:090603[090603] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.3969/j.issn.1000-2650.2007.02.003

馆 藏 号:203145489...

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