多种基因分型技术在识别结核分枝杆菌基因型的联合应用

作     者：胡屹 蒋伟利 赵琦 王伟炳 徐飚 HU Yi;JIANG Wei-li;ZHAO Qi;WANG Wei-bing;XU Biao

作者机构：复旦大学公共卫生学院流行病学教研组上海200032 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(30771843) 上海重点学科建设项目资助项目(B118) 

出 版 物：《中华结核和呼吸杂志》 (Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases)

年 卷 期：2009年第32卷第8期

页      码：576-580页

摘      要：目的评价MTB散在分布重复单位（MIRUs）和IS5110限制性内切酶片段长度的多态性（IS6110-RFLP）基因分型技术，以及两者联合应用在我国华东农村地区MTB分子流行病学研究中的应用及其效果。方法以人群为基础的横断面研究设计，采用比例法确定2004-2005年从浙江省德清县和江苏省灌云县收集的351株MTB菌株的耐药性，利用间隔区寡核苷酸分型方法识别北京基因型MTB，并进行MIRUs和IS6110-RFLP独立基因分型和串联联合应用。结果先对351株MTB菌株采用MIRUs基因分型可以识别235种基因型，包括46个成簇基因型和189个惟一基因型，分辨力为0．9317；用IS6110-RFLP可进一步从成簇基因型中识别出28个亚组，分辨力为0．9989。相对而言，先对目标菌株采用IS6110一RFLP基因分型，可识别267基因型，分辨力为0．9684，包括46个成簇基因型和221个惟一基因型，再用MIRUs基因分型技术可进一步从成簇基因型中识别出31个亚型，分辨力为0．9992。两种顺序不同联合分型方法的基因分型的辨别能力相似，尤其是在耐多药MTB（分辨力分别为0．9965和0．9963）及北京基因型MTB（分辨力分别为0．9930和0．9933）的分型中。结论MIRUs分型的方法简便、快速，结果有效、可靠，在大规模的结核病分子流行病学研究中，可先采用MIRUs，再对成簇MTB菌株进行IS6110-RFLP二次分型的联合分型策略。

主 题 词：分枝杆菌 结核 串联重复序列 限制性内切酶图谱法 基因型 

学科分类：1002[医学-临床医学类] 100210[100210] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1001-0939.2009.08.007

馆 藏 号：203147102...