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中甸牦牛mtDNA D-Loop区遗传多样性及系统进化分析

中甸牦牛mtDNA D-Loop区遗传多样性及系统进化分析

作     者:涂世英 汪琦 柴志欣 钟金城 

作者机构:云南省动物卫生监督所昆明650000 西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室成都610041 西南民族大学青藏高原研究院成都610041 

基  金:四川省科技计划项目(2015JY0248) 

出 版 物:《中国草食动物科学》 (China Herbivore Science)

年 卷 期:2016年第36卷第3期

页      码:5-10页

摘      要:根据牦牛线粒体DNA序列设计引物,扩增获得了中甸牦牛线粒体D-loop区全序列,并以山羊为外属对牛亚科部分牛种(野牦牛、九龙牦牛、麦洼牦牛、西藏牦牛、天祝牦牛、青海牦牛、大通牦牛、美洲野牛、欧洲野牛、印度野牛、亚洲水牛和普通牛)的mt DNA D-loop序列进行了系统进化分析,以期了解中甸牦牛的遗传多样性,从而为中甸牦牛遗传资源的保护、开发和利用奠定理论基础。结果表明:(1)中甸牦牛线粒体D-loop区序列长在890~910 bp之间,T、C、A、G四种碱基的平均含量分别为28.78%、24.41%、32.34%和14.47%,存在一定的碱基组成偏倚性;(2)中甸牦牛共有13种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.983 3,平均核苷酸多样性(Pi)为0.005 34,遗传多样性较为丰富;(3)中甸牦牛与已知牛种mt DNA D-loop区序列双参数距离显示,其与麦洼牦牛距离最小(0.006),与亚洲水牛距离最大(0.179);(4)系统进化分析显示,中甸牦牛是我国众多家牦牛类群中的一支,与麦洼牦牛聚为一类,推测其可能与麦洼牦牛因地理位置存在基因交流,由共同祖先进化而来。

主 题 词:中甸牦牛 D-loop区 牛亚科 系统发育 

学科分类:0905[农学-林学类] 09[农学] 

D O I:10.3969/j.issn.2095-3887.2016.03.002

馆 藏 号:203147411...

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