美洲大蠊泛素基因的克隆及生物信息学分析

作     者：金小宝 刘雷山 朱家勇 马艳 王艳 JIN Xiao-bao;LIU Lei-shan;ZHU Jia-yong;MA Yan;WANG Yan

作者机构：广东药学院基础学院寄生虫学教研室广东广州510006 

出 版 物：《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期：2007年第2卷第5期

页      码：371-373,392页

摘      要：目的克隆美洲大蠊(Periplaneta americana)泛素基因,并对序列进行相关分析。方法依据其他物种泛素基因的保守区设计1对简并引物,对美洲大蠊cDNA模板进行RT-PCR扩增,产物纯化后行T-A克隆、测序和酶切鉴定,运用相关生物信息学软件对该基因核苷酸序列进行分析和预测其编码蛋白的理化性质及二级结构等。结果从美洲大蠊体中克隆了泛素基因的编码区,被GenBank收录,登录号为EF101563。生物信息学分析结果表明,美洲大蠊泛素基因编码区的长度为228 bp,编码的多肽由76个氨基酸残基组成,相对分子质量单位为8.53 ku,理论等电点为6.56,与其他真核生物泛素基因在氨基酸水平上具有96%以上的相似性,二级结构中α-螺旋占26.3%,无规则卷曲占47.3%,延伸串占26.3%。结论成功克隆了美洲大蠊泛素基因,并进行了相关生物信息学分析,为进一步研究泛素在美洲大蠊机体内的作用奠定了基础。

主 题 词：美洲大蠊 泛素基因 克隆 生物信息学 分析 

学科分类：1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1673-5234.2007.05.016

馆 藏 号：203148554...