2012年河南省猪流行性腹泻病毒分离株S1基因遗传变异分析

作     者：陈慧娟 吴志明 闫若潜 赵雪丽 赵明军 周兵强 孔刚锐 闫志玲 程俊贞 靳利粉 

作者机构：河南农业大学牧医工程学院河南郑州450002 河南省动物疫病预防控制中心河南郑州450008 

基　　金：河南省科技攻关计划项目"猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及其致病性研究"(132102110159) 

出 版 物：《中国畜牧兽医》 (China Animal Husbandry & Veterinary Medicine)

年 卷 期：2014年第41卷第3期

页      码：14-18页

摘      要：为分析2012年河南省猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传变异情况，本研究设计合成2对扩增s1基因的特异性引物，利用RT—PCR方法，对2012年分离的5株PEDV毒株的S1基因进行扩增、克隆和序列测定，并对其进行遗传进化分析。结果表明，5株PEDVs1基因核苷酸和氨基酸同源性分别为98．3％～99．5％和97．1％～98．9％；与2011年以来国内登录的PEDV流行变异株核苷酸同源性为88．6％～98．0％，氨基酸同源性为85．3％～98．7％；与经典毒株cV777核苷酸同源性为88．7％～89．1％，氨基酸同源性为87．3％～88．4％。5株分离株s1基因均存在相同的插入和缺失，与2011年以来国内登录的流行变异毒株相比没有大的变异，但与参考毒株CV777相比，在163l66bp处有3个核苷酸插入；在l73l74bp之间有9个核苷酸插人；在405—406bp之间有3个核苷酸插入；在463464bp之间有3个核苷酸缺失，这些位点核苷酸的插入和缺失导致了其编码的氨基酸相应改变。s1基因系统进化树分析结果表明，5株分离株与2011年以来国内登录的流行变异毒株均属于基因Ⅲ群，与2011年国内登录的少部分PEDV基因Ⅰ群流行毒株的核苷酸同源性为88．6％～89．3％，氨基酸同源性为85．3％～86．9％，而经典毒株CV777所在分支群属于基因Ⅱ群。本试验结果表明，2011年以来，中国流行的PEDV毒株中同时有基因Ⅲ和Ⅰ群的存在，但以基因Ⅲ群毒株为主，其致病性和抗原性差异仍有待进一步研究。

主 题 词：猪流行性腹泻病毒 S1基因 遗传变异 分析 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

馆 藏 号：203148838...