人偏肺病毒广州分离株全基因组序列测定及分析

作     者：钟家禹 朱冰 华亮 谢嘉慧 王长兵 ZHONG Jia-yu;ZHU Bing;HUA Liang;XIE Jia-hui;WANG Chang-bing

作者机构：广州市妇女儿童医疗中心(儿童医院)中心实验室510120 

基　　金：基金项目:广东省卫生厅资助项目(A2009548) 广州市卫生局资助项目(2008YB050) 

出 版 物：《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)

年 卷 期：2010年第30卷第10期

页      码：909-913页

摘      要：目的 探讨广州地区儿童感染的偏肺病毒基因组分子结构特点和基因型类型.方法 参考GenBank上的偏肺病毒00-1株（AF371337）基因组设计分段扩增引物,进行RT-PCR分段扩增偏肺病毒基因组,克隆于T载体上,序列测定,用Clustal W/X、DNASTAR、MEGA4.1等软件分析基因组序列.结果 偏肺病毒hMPVgz01全基因组为13 327 bp,提交到GenBank上的序列号为GQ153651,有8个开放阅读框（open reading frames,ORFs）,基因组结构为：3-N-P-M-F-M2-SH-G-L-5;将hMPVgz01株全基因组核苷酸序列与GenBank上的偏肺病毒全基因组序列进行Clustal W比较,发现与偏肺病毒的A组相似性较高,为92%～97%,与A2b组的BJ1887相似性为最高,而与B组相似性为81%,与C组的禽偏肺病毒为71%.将hMPVgz01株的N、F、G基因与偏肺病毒的A1、A2、B1、B2的相对应基因进行相似性比较,同样也是与A2b型的相似性为最高,因此确认广州地区的hMPVgz01株为A2b型.结论 广州地区儿童感染的偏肺病毒hMPVgz01株全基因组序列为13 327 bp,GenBank 序列号为GQ153651,hMPVgz01与偏肺病毒的A2b型相似性最高,确认hMPVgz01株属于偏肺病毒A2b型.

主 题 词：人偏肺病毒 基因组 序列分析 基因亚型A2b 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 100202[100202] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2010.10.008

馆 藏 号：203148960...