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TaqManMGB蛋白探针法检测IL28b rs12979860位点基因多态性

TaqManMGB蛋白探针法检测IL28b rs12979860位点基因多态性

作     者:王娟 Bergqvist Anders 苏明权 郝晓柯 马越云 WANG Juan;Bergqvist Anders;SU Ming-quan;HAO Xiao-ke;MA Yue-yun

作者机构:第四军医大学西京医院检验科西安710032 瑞典乌普萨拉大学医院临床病毒学研究所 

出 版 物:《中华检验医学杂志》 (Chinese Journal of Laboratory Medicine)

年 卷 期:2013年第36卷第8期

页      码:722-726页

摘      要:目的建立一种TaqManreal—timePCR探针杂交法,用于快速检测人rs12979860位点多态性。方法从人各不同组织器官中提取基因组DNA,利用小沟结合蛋白(MGB)探针的高度特异性,设计相应的引物探针,根据实时荧光定量PCR过程中产生的信号在2个检测通道的强弱变化来鉴别等位基因差异。最后所测样本经DNA测序验证结果的准确性。采用x。检验进行统计分析。结果利用TaqManMGB蛋白作为探针,能够区分只有1个碱基差异的目标基因组片段。该方法最低检测浓度为1.5ng/μl,扩增有效率达97.6%。不同组织器官(肾、心脏、子宫、血浆)及分泌物(鼻咽部)的DNA均可以用于检测。在随后对40例高加索人和50例黄种人的检测中亦证实,rsl2979860位点的基因型及等位基因频率存在差异,高加索人以CT基因型为主(26/40),而黄种人以cc基因型为主(40/50),差异有统计学意义()(。=18.75,P〈0.05)。在两种族人群中,抗病毒治疗血清学转换与患者基因型之间差异无统计学意义(P均〉0.05)。结论TaqManMGB法能快速并准确地区分rsl2979860位点多态性,具有高度特异性和灵敏度,适用于多种样本的临床检测,是对丙肝患者抗病毒个体化治疗进行遗传分析的理想工具。

主 题 词:白细胞介素类 多态性 单核苷酸 实时聚合酶链反应 核酸探针 肝炎病毒属 

学科分类:0831[工学-公安技术类] 08[工学] 

核心收录:

D O I:10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2013.08.012

馆 藏 号:203150358...

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