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兰州鲇线粒体Cytb基因的克隆与序列分析

兰州鲇线粒体Cytb基因的克隆与序列分析

作     者:吴旭东 肖伟 连总强 侯玉霞 WU Xu-Dong;XIA0 Wei;LIAN Zong-Qiang;H0U Yu-Xia

作者机构:甘肃农业大学动物科学技术学院兰州730070 宁夏回族自治区水产研究所银川750001 中国农业大学理学院北京100193 

基  金:国家自然科学基金项目(30760191)资助 

出 版 物:《水生生物学报》 (Acta Hydrobiologica Sinica)

年 卷 期:2014年第38卷第4期

页      码:772-779页

摘      要:为克隆兰州鲇(Silurus lanzhouensis)线粒体Cytb基因全序列,根据欧洲鲇(Silurus glanis)线粒体基因全序列设计特异引物进行兰州鲇线粒体Cytb基因的PCR扩增,得到1138 bp兰州鲇线粒体Cytb基因序列。对兰州鲇和其他13种鱼的线粒体Cytb基因核苷酸和氨基酸序列之间进行同源性比较,结果显示具有较高的同源性,核苷酸同源性介于61.38%—91.12%,氨基酸同源性介于76.62%—95.52%。对兰州鲇、欧洲鲇、大口鲇(Silurus meridionalis)、鲇(Silurus asotus)、越南鲇(Silurus cochinchinensis)的Cytb基因之间进行碱基替代分析,结果显示兰州鲇Cytb基因与鲇之间替换率最低,值为8.87%,转换/颠换值为3.21;与越南鲇之间替换率最高,值为14.41%,转换/颠换值为1.83。对本文克隆的兰州鲇Cytb基因与王庆容等测定的兰州鲇线粒体Cytb序列进行序列差异分析,结果显示两者之间替换率为11.16%,存在127个变异位点,转换/颠换比为4.08,遗传距离为0.1230。由NJ法基于兰州鲇和其他13种鱼的Cytb基因序列构建的系统进化树,结果显示与传统的分类地位基本吻合。

主 题 词:兰州鲇 线粒体Cytb 序列分析 

学科分类:0908[0908] 09[农学] 

核心收录:

D O I:10.7541/2014.108

馆 藏 号:203150414...

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