适用于玉米DNA指纹库构建的SSR核心引物的重新设计与优化

作     者：于新艳 王凤格 赵久然 王玺 易红梅 王璐 郭景伦 匡猛 孙艳美 Yu Xinyan;Wang Fengge;Zhao Jiuran;Wang Xi;Yi Hongmei;Wang Lu;Guo Jinglun;Kuang Meng;Sun Yanmei

作者机构：沈阳农业大学农学院沈阳110161 北京市农林科学院玉米研究中心北京100097 

基　　金：北京农业育种基础研究创新平台 北京市自然科学基金项目(YZPT02-06)资助 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2007年第5卷第3期

页      码：443-447页

摘      要：为了确定出适用于玉米DNA指纹库构建的引物,对部分并不是完全符合玉米DNA指纹库构建引物筛选原则的引物进行重新设计与优化,使其基本符合核心引物设计的要求。以umc2105、umc1705和phi299852为例,下载原引物的基因组序列,利用两个常用的引物设计软件Primer Premier5.0和Oligo6.57进行引物的重新设计及评估,在Tm值、GC含量、引发效率、错误引发率、3 端G值、引物二聚体等方面对引物进行改善,结果表明,经过对原引物的重新设计和优化,新设计的引物均能清晰的扩增,扩增效果得到了明显的改善,并且均能在统一的条件下进行实验,符合了玉米DNA指纹库构建的要求。

主 题 词：玉米 SSR 核心引物 引物设计 

学科分类：09[农学] 0901[农学-植物生产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1672-416X.2007.03.025

馆 藏 号：203151627...