黄颡鱼微卫星标记的筛选及三个野生群体的遗传结构分析

作     者：吴勤超 梁宏伟 李忠 呼光富 罗相忠 沈子伟 邹桂伟 Wu Qinchao;Liang Hongwei;Li Zhong;Hu Guangfu;Luo Xiangzhong;Shen Ziwei;Zou Guiwei

作者机构：华中农业大学水产学院武汉430070 中国水产科学研究院长江水产研究所农业部淡水生物多样性保护与利用重点开放实验室荆州434000 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心无锡214081 

基　　金：国家科技基础条件平台专项(2006DKA30470-002) 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2010年第26卷第3期

页      码：154-159,163页

摘      要：为了探明长江中上游流域黄颡鱼野生群体的遗传多样性状况和遗传结构,本研究采用磁珠富集法筛选出10个黄颡鱼微卫星标记,并利用其对长江中上游流域3个黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidrac)野生群体(赤水群体、乐山群体、洞庭群体)的遗传结构进行分析。获得65个阳性克隆并测序,得到36个含有微卫星的序列,设计并合成了22对微卫星引物,经筛选得到10对多态性稳定的引物,其中高多态性位点6个,中多态位点3个。每对引物等位基因数2-9个,平均4.8。3个群体(赤水、乐山和洞庭)的平均多态信息含量(PIC)分别为0.5438、0.4568和0.3965,平均有效等位基因(Ne)分别为2.9928、2.5401和2.1713,平均期望杂合度(He)分别为0.6280、0.5277和0.4757,表明这3个群体遗传多样性水平较高,其中赤水群体遗传多样性最高,洞庭群体最低。种群分化指数(Fst)和遗传距离(Ds)分析表明,洞庭群体和乐山群体之间的亲缘关系最近,而与赤水群体的亲缘关系最远。聚类分析显示,乐山群体和洞庭群体聚为一支,赤水群体单独聚为一支。

主 题 词：黄颡鱼 微卫星标记 群体遗传 遗传多样性 

学科分类：0908[0908] 09[农学] 

D　O　I：10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2010.03.041

馆 藏 号：203151737...