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应用改进型遗传算法进行药物分子对接设计

应用改进型遗传算法进行药物分子对接设计

作     者:李纯莲 王希诚 赵金城 Li Chunlian 1 Wang Xicheng 2 Zhao Jincheng 31 (Dept.of Comp.Sci.and Tech.of the school of Electr.and Info.Eng.,Dalian Univ.of Tech.,Dalian116023) 2 (State Key Laboratory of Structural Analysis of Industrial Equipment ,Dalian University of Technology,Dalian116023) 3 (Institute of Bio-information and Molecular Design,Dalian University,Dalian116621)

作者机构:大连理工大学电信学院计算机科学技术系大连116023 大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室大连116023 大连大学生物信息学与分子设计研究所大连116621 

基  金:国家自然科学基金项目(编号:10272030) 国家973基础研究发展规划项目(编号:19990328) 

出 版 物:《计算机工程与应用》 (Computer Engineering and Applications)

年 卷 期:2003年第39卷第36期

页      码:31-33,89页

摘      要:文章建立了一种约束优化的演化模型,并构造出求解此模型的多种群空间收缩遗传算法,将信息熵概念引入进化过程,控制各种群寻优搜索时解空间的收缩。该算法用种群的多样性避免遗传进化的早熟现象,并以空间收缩尺度作为停机判椐,有效地控制了算法的收敛。利用基于小种群的多种群进化策略,在保证种群多样性的前提下,极大程度地减少了计算量,提高了计算效率。数值算例表明,熵的介入增强了随机搜索类进化算法的寻优目的性,使收敛过程平稳且迅速。算例表明此算法能有效的应用于药物分子对接设计。

主 题 词:药物设计 药物分子 改进型遗传算法 对接设计 计算机辅助设计 

学科分类:1305[艺术学-设计学类] 1007[医学-药学类] 13[艺术学] 08[工学] 080203[080203] 081304[081304] 0802[工学-机械学] 0813[工学-化工与制药类] 10[医学] 080201[080201] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1002-8331.2003.36.010

馆 藏 号:203152067...

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