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检测乙型肝炎病毒“a”决定簇热点突变基因芯片的制备和初步应用

检测乙型肝炎病毒“a”决定簇热点突变基因芯片的制备和初步应用

作     者:张瑞 李荣成 李艳萍 王升启 梁争论 李河民 庄辉 ZHANG Rui;LI Rong-cheng;LI Yan-ping;WANG Sheng-qi;LIANG Zheng-lun;LI He-min;ZHUANG Hui

作者机构:中国药品生物制品检定所北京100050 广西壮族自治区疾病预控制中心 军事医学科学院 北京大学医学部 

基  金:国家“十五”科技攻关资助项目(2004BA718802) 

出 版 物:《中华肝脏病杂志》 (Chinese Journal of Hepatology)

年 卷 期:2007年第15卷第2期

页      码:103-106页

摘      要:目的为快速、高通量检测HBV“a”决定簇热点突变,制备基因芯片,并进行了初步应用。方法应用HBV基因保守序列设计PCR扩增引物,针对“a”决定簇突变设计简并探针,制备了检测126A、126S、144A、145R、145E、144A+145R和144A+145E突变的基因芯片。通过对质粒参考品或样本进行测定,以评价芯片的特异性、灵敏度、重复性和检测劣势株的能力,并对45例乙型肝炎患者的血清样本同时应用基因芯片和PCR产物直接测序法进行检测比较。结果所制备的基因芯片能特异性检测出质粒参考品,灵敏度为5×10^3拷贝/μl。同一样本检测10次,芯片内和芯片间变异系数均小于15%。当劣势株占HBV毒株10%以上时,基因芯片即可检出。芯片法测得45例样本中126A、126S-1和126S-2的阳性率(分别为46.67%、35.56%和24.44%)显著高于PCR产物直接测序法(分别为9.00%、4.44%和2.22%;P值分别为0.000、0.000和0.002),克隆测序验证了基因芯片法的特异性。结论基因芯片法可快速、有效地检测HBV特定位点突变株,为HBV突变的大规模筛查提供了方法。

主 题 词:肝炎病毒 乙型 基因芯片 突变 “a”决定簇 

学科分类:1002[医学-临床医学类] 100210[100210] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3760/j.issn:1007-3418.2007.02.006

馆 藏 号:203153155...

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