中国乙型肝炎病毒B、C基因型参照序列的建立

作     者：张振华 张玲 陆蒙吉 杨东亮 李旭 ZHANG Zhen-hua;ZHANG Ling;LU Meng-ji;YANG Dong-liang;LI Xu

作者机构：安徽医科大学附属第一医院感染科合肥230022 德国Essen大学病毒学研究所 华中科技大学同济医学院附属同济医院临床免疫室 

基　　金：国家自然科学基金(30771907) 安徽省教育厅基金(KJ2008B300) 

出 版 物：《中华肝脏病杂志》 (Chinese Journal of Hepatology)

年 卷 期：2009年第17卷第12期

页      码：891-895页

摘      要：目的建立中国HBVB、C基因型参照序列。方法从GenBank中获得来源于中国不同地区的HBV全基因序列，通过基因分型和序列比对，以相同位置频率最高碱基作为参照碱基建立序列；将这些参照序列与国内外的参照序列进行比较，了解其中的不同点；对不同编码区的氨基酸序列进行比较。对B、C基因型HBV的碱基替代情况进行统计学分析，其中1762、1764、1896位点采用妒检验，1858位点采用Fisher＇s确切概率法检验。结果获得了中国HBV B、C基因型参照序列。Bc与Ba、Bj基因型HBV的全基因序列同源性分别为99．32％、95．52％，S基因序列同源性分别为99．71％、98．68％；Cc与C、Caus基因型的全基因序列同源性分别为98．44％、93．97％，S基因序列同源性分别为99．27％、95．01％。与Bj型相比，Bc和Ba型同源性更高；与Caus型相比，Cc和C型同源性更高。不同编码区的氨基酸序列也有差异；两种基因型在1762、1764、1858位点的碱基分布差异均有统计学意义（P值均〈0．05）。结论建立的HBV B、C基因型参照序列可以作为中国HBV参照序列，为设计引物和分析碱基或（和）氨基酸变异提供参考。

主 题 词：肝炎病毒,乙型 基因型 变异 参照序列 

学科分类：1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1007-3418.2009.12.003

馆 藏 号：203153263...