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基于黄瓜基因组重测序的InDel标记开发及其应用

基于黄瓜基因组重测序的InDel标记开发及其应用

作     者:李斯更 沈镝 刘博 邱杨 张晓辉 张忠华 王海平 李锡香 

作者机构:中国农业科学院蔬菜花卉研究所/农业部蔬菜作物基因资源与种质创制北京科学观测实验站北京100081 

基  金:国家自然科学基金项目(31171961) 农业部资源保护项目(NB2012-2130135-28) "948"项目(2011-G1-02) 农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目 

出 版 物:《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期:2013年第14卷第2期

页      码:278-283页

摘      要:基于黄瓜基因组重测序结果,搜索InDel位点,按照每隔1~3M个碱基对的距离选择并设计遍布全基因组的代表性InDel引物134对,以16份黄瓜典型种质检测其有效性。结果显示,134对引物均获得扩增产物,其中具有多态性的引物116对,占引物总数的86.6%。116对引物充分揭示出16份种质的多样性和特异性。本研究所开发的InDel分子标记将为黄瓜种质资源和分子遗传育种研究提供有力的遗传工具。

主 题 词:黄瓜 重测序 InDel标记 种质鉴定 

学科分类:09[农学] 0902[农学-自然保护与环境生态类] 090202[090202] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1672-1810.2013.02.014

馆 藏 号:203153411...

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