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基于颜色判定的环介导逆转录等温扩增技术检测柯萨奇病毒A6型

基于颜色判定的环介导逆转录等温扩增技术检测柯萨奇病毒A6型

作     者:关丽 许松涛 聂凯 张丹 李鑫娜 许文波 马学军 Guan Li;Xu Songtao;Nie Kai;Zhang Dan;Li Xinna;Xu Wenbo;Ma Xuejun

作者机构:中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 广州医科大学基础医学院 

基  金:"'艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治"'科技重大专项(2013ZX10004-001、2012ZX10004-215、2013ZX10004-202、2013ZX10004804-007) 

出 版 物:《中华预防医学杂志》 (Chinese Journal of Preventive Medicine)

年 卷 期:2015年第49卷第11期

页      码:1009-1013页

摘      要:目的建立基于羟基萘酚蓝(hydroxynaphtholblue,HNB)颜色变化的简单、灵敏和快速的环介导逆转录等温扩增技术(RT—LAMP)检测方法,应用于柯萨奇病毒A6型(coxsackievirusA6,CV-A6)的检测。方法针对CV-A6的VPl基因设计6条特异引物,在等温条件下(63℃)进行50min扩增反应。扩增前在反应体系中加入HNB,通过观察颜色变化进行检测结果判定。使用多种肠道病毒进行特异性验证,使用梯度稀释的体外转录CV-A6全VP1基因RNA进行灵敏度分析,同时与实时荧光定量逆转录PCR(rRT—PCR)检测结果进行比较,并对92份手足口病患者临床标本进行检测。结果本研究建立的RT-LAMP方法对除CV-A6外的23种肠道病毒的检测结果均为阴性,灵敏度为100拷贝/反应,与rRT—PCR方法相当。在对92份手足口病临床标本的检测中,检测结果与rRT-PCR方法相符,Kappa值为1,灵敏度和特异性均为100%。结论本研究建立的针对CV-A6的LAMP检测方法,特异度高,灵敏度与rRT—PCR相当,有望应用于CV—A6感染的快速筛选,具有在基层医疗卫生机构和现场推广与应用的潜力。

主 题 词:聚合酶链反应 柯萨奇病毒感染 环介导逆转录等温扩增 

学科分类:100208[100208] 1002[医学-临床医学类] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2015.11.016

馆 藏 号:203153536...

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