诺如病毒深圳株SZ2010422全基因组序列测定及分析

作     者：张翠红 覃家剑 何雅青 张海龙 李慧莹 靳森 陈克娜 封少龙 段招军 

作者机构：南华大学公共卫生学院湖南衡阳421001 广西桂林医学院生物技术学院 深圳市疾病预防控制中心 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 温州医科大学 

基　　金：国家自然科学基金项目 "十二五"国家科技重大专项 

出 版 物：《中华实验和临床病毒学杂志》 (Chinese Journal of Experimental and Clinical Virology)

年 卷 期：2013年第27卷第3期

页      码：181-183页

摘      要：目的 分析GⅡ-4型诺如病毒深圳分离株SZ2010422全基因组序列,了解其分子结构特点及进化特性.方法 根据New Orleans参考株全序列设计引物,用RT-PCR分段扩增诺如病毒全基因组,经分子克隆、测序后进行系统进化分析及衣壳区氨基酸位点分析.结果 GⅡ-4型诺如病毒深圳SZ2010422株病毒基因组全长7559 bp,病毒基因组分三个开放阅读框（ORFs）,ORF1、ORF2及ORF3长度分别为5100 bp、1623 bp和807 bp,ORF1与ORF2之间有19个核苷酸重叠.深圳株SZ2010422基因组核苷酸序列与参考株GⅡ-4型New Orleans变异株同源性最高,全长同源性为99.3％,ORFI、ORF2、ORF3同源性分别为99.5％、99.2％和98.6％.根据系统进化分析,深圳SZ2010422株属于GⅡ-4 New Orleans变异株.通过对衣壳区氨基酸比对,New Orleans变异株位点变化情况为：aa310N或K→S,aa341D→N,aa359T→S,aa396H→P,aa460H→Y.结论 诺如病毒深圳株SZ2010422属于GⅡ-4型New Orleans变异株.

主 题 词：诺如病毒 基因 序列分析 

学科分类：1001[医学-基础医学] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2013.03.007

馆 藏 号：203154959...