应用焦磷酸测序鉴定马铃薯感染的马铃薯Y病毒株系

作     者：刘洪义 梁五生 刘忠梅 张洪祥 杨立群 

作者机构：黑龙江出入境检验检疫局检验检疫技术中心/国家马铃薯病毒检测重点实验室哈尔滨150001 浙江大学农业与生物技术学院生物技术研究所/水稻生物学国家重点实验室杭州310058 

基　　金：国家质量监督检验检疫总局科技计划项目"基于PyroMark ID平台的马铃薯Y病毒检疫鉴定技术研究"(2008IK242) 国家自然科学基金资助项目"交替氧化酶诱导植物抗病毒侵染的机理研究"(30870187) 

出 版 物：《中国农学通报》 (Chinese Agricultural Science Bulletin)

年 卷 期：2013年第29卷第36期

页      码：140-146页

摘      要：为了检验是否可以通过焦磷酸测序法进行短序列测序,来鉴别马铃薯Y病毒(PVY)株系,从NCBI库中选取了代表9个PVY株系的全基因组序列30个,通过比对P1和CP蛋白的氨基酸序列,分别找出一个差异区段,针对这2个区域设计了反转录引物、PCR引物和测序引物。分别从黑龙江省克山县和讷河市各采集了一份马铃薯病叶样品,通过提取总RNA,反转录,再进行PCR扩增获得扩增产物,并对扩增产物进行了焦磷酸测序。测序结果显示,尽管2份马铃薯病叶症状不同,但均感染了PVY(N-Wi株系)(PVYN-Wi)。上述研究表明,利用本试验设计的引物,通过焦磷酸测序法进行短序列测序,可以鉴定马铃薯感染的PVY株系。

主 题 词：马铃薯 马铃薯Y病毒 病毒株系鉴定 焦磷酸测序 

学科分类：09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

馆 藏 号：203154980...