GeneSifter在基因表达谱芯片数据挖掘中的应用

作     者：廖之君 马文丽 梁爽 郑文岭 LIAO Zhi-jun;MA Wen-li;LIANG Shuang;ZHENG Wen-ling

作者机构：南方医科大学基因工程研究所 华南基因组研究中心广东广州510800 

基　　金：广东省重点实验室基金资助 

出 版 物：《医学信息（西安上半月）》 (Medical Information)

年 卷 期：2007年第20卷第11期

页      码：1882-1887页

摘      要：介绍一款基因芯片数据分析工具──GeneSifter软件,具有快速、直观、便捷等特点,尤其适用于基因表达谱的数据挖掘。芯片数据一般以格式化文本文档形式上载,根据实验目的、设计不同,总共有4种上载向导工具,数据分析从控制台Analysis项目下的Pairwise或Projects进入,需要设置滤过、阈值和统计分析等参数,Pairwise可获得的结果有:差异显著性基因列表、基因本体报告和KEGG通路报告等,Projects有更为强大的功能,可获取聚类等6种结果。GeneSifter独特的一站式单击设置,可获得相关基因的11个数据库最新链接。GeneSifter适用于基因芯片数据挖掘的生物研究人员。

主 题 词：GeneSifter软件 数据挖掘 基因本体术语 KEGG通路 聚类 

学科分类：1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1006-1959.2007.11.006

馆 藏 号：203156250...