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一个基于软件设计模式的生物信息存储模式

一个基于软件设计模式的生物信息存储模式

作     者:杨进才 赵森 刘小姣 胡金柱 YANG Jin-cai;ZHAO Sen;LIU Xiao-jiao;HU Jin-zhu

作者机构:华中师范大学计算机科学系武汉430079 

出 版 物:《计算机应用研究》 (Application Research of Computers)

年 卷 期:2010年第27卷第7期

页      码:2598-2601页

摘      要:为了消除各生物信息学数据库之间的模式异构问题,根据生物信息的存储现状,提出了一种存储模式。该模式从物种、类别、基本信息、功能和测序方法五个方面对数据中的信息进行抽象。运用了软件设计模式的思想,通过"派生""组装"等面向对象的方法生成与模式对应的XML schema文件。抽象出的存储模式不但能使数据之间的关系更加紧密,而且可以形成交叉索引的完整生物信息体系。

主 题 词:生物信息抽象 生物数据存储模式 设计模式 可扩展标记语言 

学科分类:0831[工学-公安技术类] 0711[理学-心理学类] 07[理学] 08[工学] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1001-3695.2010.07.055

馆 藏 号:203156359...

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