川中黑山羊BMP2、BMP4基因cDNA克隆及生物信息学分析

作     者：龙石太 胡亮 吴宪红 字向东 

作者机构：动物遗传育种学国家民委-教育部共建重点实验室/西南民族大学四川成都610041 

基　　金：西南民族大学研究生创新型科研项目(编号:CX2013SZ56) 

出 版 物：《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期：2014年第42卷第3期

页      码：19-23页

摘      要：参照GenBank已公布的绵羊BMP2基因序列与牛BMP4基因序列分别设计一对引物,以川中黑山羊卵巢总RNA为模板,采用RT-PCR技术扩增川中黑山羊BMP2基因和BMP4基因的cDNA序列并进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果表明,川中黑山羊BMP2基因编码区全长为1 188 bp(GenBank登录号为KF492982),BMP4基因编码区全长为1 230 bp(GenBank登录号为KF492983),分别编码395、409个氨基酸。川中黑山羊与绵羊、牛、猪、人、马、鼠、鸡BMP2基因编码区序列的同源性分别为99.7%、98.7%、92.0%、89.6%、91.4%、86.1%、78.9%;川中黑山羊与绵羊、牛、猪、人、马、鼠、鸡BMP4基因编码区序列的同源性分别为99.3%、99.1%、95.9%、95.2%、94.4%、92.0%、80.1%。用MEGA 4.0构建物种间分子系统进化树,结果显示,BMP2基因和BMP4基因的聚类反应基本一致,川中黑山羊首先与绵羊聚类,再分别与牛、猪、马、人和鼠聚类,最后与鸡聚类,这与动物分类学基本吻合。

主 题 词：川中黑山羊 BMP2基因 BMP4基因 克隆 生物信息学 

学科分类：0905[农学-林学类] 09[农学] 090501[090501] 

D　O　I：10.15889/j.issn.1002-1302.2014.03.096

馆 藏 号：203156532...