油茶甘油二酯激酶基因(CoDGK3)的克隆与表达分析

作     者：江南 张维利 李捷宇 刘奇龙 刘敏 JIANG Nan;ZHANG Weili;LI Jieyu;LIU Qilong;LIU Ming

作者机构：湖南工业大学包装与材料工程学院湖南株洲412008 中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004 

基　　金：湖南省科技计划项目(2012NK3065) 

出 版 物：《食品与生物技术学报》 (Journal of Food Science and Biotechnology)

年 卷 期：2014年第33卷第10期

页      码：1090-1095页

摘      要：以油茶转录组数据为基础,采用RT-PCR和RACE技术,根据Unigene序列设计油茶甘油二酯激酶基因(Co DGK)RACE引物,分离克隆了DGK基因全长c DNA序列,命名为Co DGK3(Gene Bank登录号:KM068056),基因全长1 568 bp,开放阅读框1 455 bp,编码485个氨基酸;氨基酸同源比对及序列分析表明油茶与其它物种的DGK氨基酸序列具有较高的相似性,其中与麻风树和毛果杨相似性最高,达到78%;利用生物学软件对蛋白质进行生物信息学分析,获得其结构特点及理化性质;分析转录组数据中DGK相关的Unigene序列RTKM值和对Co DGK3基因实施实时荧光定量PCR,结果表明Co DGK3在油茶种子发育各时期表达量变化差异不大,并且发现转录组数据分析和实时荧光定量分析的结果变化规律一致,证明了转录组测序的有效性。

主 题 词：油茶 甘油二酯激酶基因 克隆 生物信息学分析 基因表达 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 090102[090102] 

核心收录：

馆 藏 号：203156575...