假单胞菌噬菌体裂解酶生物信息挖掘与系统分析

作     者：惠潇然 黄振华 刘静 吴倩 许天明 段为旦 潘迎捷 赵勇 张昭寰 HUI Xiao-ran;HUANG Zhen-hua;LIU Jing;WU Qian;XU Tian-ming;DUAN Wei-dan;PAN Ying-jie;ZHAO Yong;ZHANG Zhao-huan

作者机构：上海海洋大学食品学院上海201306 农业农村部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室(上海)上海201306 上海水产品加工及贮藏工程技术研究中心上海201306 

基　　金：国家自然科学基金面上项目(31972188) 上海市自然科学基金项目(22ZR1427500) 上海市优秀学术带头人计划资助项目(21XD1401200) 

出 版 物：《微生物学杂志》 (Journal of Microbiology)

年 卷 期：2025年第45卷第1期

页      码：14-23页

摘      要：假单胞菌属(Pseudomonas spp.)是一类重要的食源性致病菌和腐败菌。噬菌体裂解酶具有高效裂解活性和靶向性等特征,可作为有效控制假单胞菌属细菌的新型抗菌剂。随着组学技术的高速发展,大量噬菌体的基因组信息得到破译,为噬菌体裂解酶生物信息的挖掘提供了数据资源。本研究基于NCBI等数据库,深入挖掘假单胞菌噬菌体裂解酶的理化参数、核心结构域、三维结构等生物信息。结果表明,共筛选获得了81个噬菌体裂解酶序列,此类裂解酶大多为亲水蛋白(80/81),均具有较高的等电点,蛋白总体带正电。在所筛选的裂解酶序列中,共发掘9个保守结构域,分别为Lyz-like super family、yz_endolysin_autolysin、Muramidase、PGRP super family、NlpC/P60、LT-like、Phage_lysis Superfamily、PG_binding_1、PG_binding_3。同源建模分析发现,裂解酶末端α-螺旋上均分布一定的正电荷基团,预测该结构可能赋予其穿透假单胞菌外膜的功能。本研究为假单胞菌噬菌体裂解酶的设计、改造和生产提供理论支撑,为假单胞菌的靶向防控提供重要的数据基础。

主 题 词：假单胞菌 噬菌体裂解酶 生物信息学分析 结构 功能预测 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 07[理学] 071005[071005] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1005-7021.2025.01.002

馆 藏 号：203157512...