SARS冠状病毒检测60mer寡核苷酸基因芯片的设计及应用

作     者：广东省防治非典型肺炎科技攻关病原分离组 石嵘 马文丽 吴清华 张宝 宋艳斌 郭秋野 肖维威 王艳 郑文岭 

作者机构：第一军医大学全军生物芯片重点实验室 广州军区广州总医院医学实验科广州510010 

出 版 物：《广东医学》 (Guangdong Medical Journal)

年 卷 期：2003年第24卷第z1期

页      码：14-17页

摘      要：目的 设计并应用60 mer寡核苷酸基因芯片实现对SARS冠状病毒的检测。方法 根据寡核苷酸基因芯片的设计原则设计出3O条60mer的寡核苷酸片段,覆盖SARS冠状病毒(以TOR2株为参考序列,GENEBANK索取号:AY274119)全基因组,点样制备成12×12的寡核苷酸基因芯片,将临床诊断SARS患者痰液标本抽提病毒RNA,采用限制性显示技术进行标记,将标记好的样品与芯片杂交,洗脱,扫描。初步探索寡核苷酸芯片诊断SARS冠状病毒的敏感性及特异性,并对芯片做进一步的优化。结果 来自SARS患者样品与芯片上的多个SARS探针杂交,出现了明显的荧光信号;阴性和空白对照探针上没有杂交信号,而对照样品仅与一个SARS探针有杂交。结论 采用60 mer寡核苷酸基因芯片可以从基因水平实现对SARS冠状病毒多段序列的平行检测,对于提高检出率有一定意义,此外,尚可用于监测在发病过程的各个阶段中病毒基因的活动状况。

主 题 词：SARS冠状病毒 寡核苷酸基因芯片 RD-PCR 荧光标记 分子杂交 

学科分类：1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1001-9448.2003.z1.005

馆 藏 号：203157632...