人溶菌酶基因的密码子优化设计及生物信息学初步分析

作     者：沈冰蕾 刘博洋 杨润军 任颖 闫守庆 白春艳 张永宏 

作者机构：黑龙江八一农垦大学动物科技学院黑龙江大庆163319 吉林大学畜牧兽医学院吉林长春130062 吉林大学农学部公共教学中心吉林长春130062 

基　　金：转基因生物新品种培育重大专项资助(2011ZX08007-001 2009ZX08009-156B 2009ZX08007-005B) 

出 版 物：《中国兽医学报》 (Chinese Journal of Veterinary Science)

年 卷 期：2012年第32卷第9期

页      码：1392-1395,1399页

摘      要：对猪乳蛋白密码子使用偏好性进行了分析,并基于其使用规则,在不改变编码氨基酸序列的基础上对人溶菌酶基因hLYZ的密码子进行了优化设计和生物信息学初步分析。研究结果表明,人hLYZ基因与猪乳蛋白相关基因的密码子使用频率存在明显差异,优化前后猪乳蛋白偏好性hLYZ基因(LYZ-Cas)共改变了109个碱基,约占hLYZ基因碱基总数的24.38%,G+C含量由47.0%下降至43.8%。改造前后hLYZ基因CDS序列所翻译的氨基酸序列比对结果显示,其氨基酸序列没有发生变化,二级结构预测及Nc值计算显示,其能够在猪乳中相对高效表达。本研究旨在分析并比较优化前后hLYZ基因密码子的生物信息学变化,使其在猪乳蛋白中高效表达,对于生产富含人溶菌酶的hLYZ转基因克隆猪具有重要的理论意义,并且对于提高仔猪成活率,防治哺乳动物乳腺炎,提高乳品质等方面具有巨大的应用潜力。

主 题 词：人溶菌酶基因 密码子优化 猪乳蛋白 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 07[理学] 071007[071007] 

核心收录：

D　O　I：10.16303/j.cnki.1005-4545.2012.09.033

馆 藏 号：203158289...