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山羊痘病毒P32基因序列分析及其B细胞表位预测

山羊痘病毒P32基因序列分析及其B细胞表位预测

作     者:文明 程振涛 岳筠 李永明 周碧君 WEN Ming;CHENG Zhen-tao;YUE Jun;LI Yong-ming;ZHOU Bi-jun

作者机构:贵州大学动物疫病研究所 

基  金:贵州省优秀科技教育人才省长专项资金资助项目("以减毒细菌为载体的山羊痘基因工程粘膜疫苗的基础研究" 黔省专合字12号) 

出 版 物:《生物技术》 (Biotechnology)

年 卷 期:2007年第17卷第5期

页      码:12-14页

摘      要:目的:比较山羊痘病毒不同分离株间P32基因的同源性,并对其B细胞表位进行预测。方法:选取GenBank上10株不同山羊痘毒株P32基因序列,采用DNAsis MAX序列分析软件对该基因序列进行同源性分析,并以B细胞表位分析参数及蛋白质二级结构分析数据,综合预测P32蛋白B细胞表位。结果:10株不同山羊痘毒株P32基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别为99.4%和98.4%;在P32蛋白的肽链中,19-60、64-80、98-118、138-182和214-275区段亲水性强,17-45、64-75、88-97、110-128、152-165和201-251区段柔韧性好,150-172、200-255区段抗原指数高,而31-59、101-119、142-145、165-172和215-252区段表面可及性高,42-56、159-181、200-208和227-259区段。结论:不同山羊痘病毒株间P32基因具有较高的同源性,P32蛋白227-251区段可能是B细胞表位优势区,为P32蛋白功能的深入研究与新型疫苗的设计提供一定的基础。

主 题 词:山羊痘病毒 P32基因 B细胞表位 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

D O I:10.16519/j.cnki.1004-311x.2007.05.013

馆 藏 号:203159323...

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