腹泻相关致病菌基因芯片的制备及应用

作     者：刘杰 伊茂礼 吴金英 李少君 孙成铭 Liu jie;Yi Maoli;Wu Jinying;Li Shaojun;Sun Chengming

作者机构：山东烟台毓璜顶医院生物芯片实验室264000 

基　　金：烟台市科技发展计划项目(2013WS210) 

出 版 物：《中华生物医学工程杂志》 (Chinese Journal of Biomedical Engineering)

年 卷 期：2014年第20卷第5期

页      码：375-379页

摘      要：目的确定引起人类感染性腹泻的11种病原微生物，并制备芯片用于检测门诊腹泻患者粪便标本中的致病菌。方法根据本院2009年1月至2012年12月期间腹泻门诊的粪便病原菌检测数据，采用生物信息学的方法，收集11种病原菌的所有基因序列，设计引物及探针，优化并制备芯片，PCR扩增杂交并对杂交结果进行分析。用该芯片对本院保存的163个肠道致病菌临床分离株进行鉴定来评价芯片的特异性，用芯片来检测掺有不同浓度沙门氏菌的粪便标本评价芯片的灵敏度。同时收集2010年6月至2013年3月在本院就诊的1052份腹泻患者粪便标本，平行进行PCR扩增、细菌培养、基因芯片检测，比较不同检测方法的阳性率。结果成功制备了腹泻相关11种致病菌检测芯片。应用制备的芯片检测了163个临床分离株，准确率达100％。与PCR方法比较，基因芯片检测沙门氏菌的灵敏度达102CFU／ml，比PCR法检测灵敏度高10倍。用该芯片对临床1052份腹泻患者腹泻标本进行检测，与传统的培养法及PCR法比较，有较高的阳性检出率，达36％，比常规细菌培养阳性率高13％（X2=2．28，P〈0．05），比PCR检出率高4％（X2=5．16，P〉0．05）。结论成功制备11种腹泻相关致病菌基因芯片，能同时对11种腹泻致病菌进行检测，有较好的特异性和灵敏度，有更高的阳性率，可以用于临床检测。

主 题 词：腹泻 细菌感染 寡核苷酸序列分析 

学科分类：1004[医学-公共卫生预防医学类] 100401[100401] 10[医学] 

D　O　I：10.3760/cma.j.issn.1674-1927.2014.05.0

馆 藏 号：203159668...