红松SSR-PCR反应体系的建立与优化

作     者：冯富娟 赵丹 孙晓艳 韩士杰 许小妍 FENG Fu-juan;ZHAO Dan;SUN Xiao-yan;HAN Shi-jie;XU Xiao-yan

作者机构：东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 东北林业大学林学院黑龙江哈尔滨150040 中国科学院沈阳应用生态研究所辽宁沈阳110016 

基　　金：中科院知识创新工程重要方向项目(SCX2-YW-N-031-2) 黑龙江省博士后科研启动金资助 

出 版 物：《经济林研究》 (Non-wood Forest Research)

年 卷 期：2010年第28卷第1期

页      码：35-40页

摘      要：为了建立红松SSR-PCR最佳反应体系,以CTAB法提取的红松针叶DNA为模板,应用单因子试验及L16(45)正交试验系统分析了DNA模板浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度、Taq酶浓度等对SSR-PCR扩增结果的影响,并对延伸时间、热循环参数进行了探讨,建立了稳定的、可重复的红松SSR-PCR最佳反应体系及PCR扩增参数。结果表明,PCR的最佳反应体系为:10μL体系中,1×PCRbuffer1μL、DNA模板50～120ng,Mg2+3mmol/L,dNTP0.4mmol/L,引物0.5μmol/L,Taq酶0.75U。利用该体系筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SSR引物13对。在此反应体系下,所扩增谱带清晰、稳定、多态性高。

主 题 词：红松 SSR 优化 正交设计 单因子试验 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 0907[农学-草药学] 07[理学] 08[工学] 0829[工学-安全科学与工程类] 09[农学] 071007[071007] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1003-8981.2010.01.007

馆 藏 号：203160957...