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实时荧光PCR检测瓜炭疽病菌

实时荧光PCR检测瓜炭疽病菌

作     者:王翀 张小菊 张祥林 张伟 张瑜 李亚伟 孙燕飞 Wang Chong;Zhang Xiaoju;Zhang Xianglin;Zhang Wei;Zhang Yu;Li Yawei;Sun Yanfei

作者机构:新疆出入境检验检疫局乌鲁木齐830063 石河子大学石河子832000 

基  金:国家质量监督检验检疫总局科研计划项目(2013IK287 2011IK168) 国家科技部质检公益性行业科研专项(201310091) 

出 版 物:《植物保护》 (Plant Protection)

年 卷 期:2016年第42卷第2期

页      码:129-135页

摘      要:采用实时荧光PCR技术建立了瓜炭疽病菌(Colletotrichum orbiculare)的检测方法。根据瓜炭疽病菌甘油醛-3-磷酸脱氢酶(GAPDH)基因和谷氨酰胺合成酶(GS)基因序列,设计了该病菌特异性引物和TaqMan探针,并对所设计的引物和探针的反应条件进行了优化。采用本试验建立的实时荧光PCR方法对瓜上的其他菌株及近似菌株进行检测,可将瓜炭疽病菌与其他病原菌区分开。灵敏度试验表明,25μL体系中只要有39.6pg的核酸量就可以被检测到,检测灵敏度达到1.584pg/μL,比普通PCR检测灵敏度高100倍。同时对田间采集的病株和未知样品进行的检测证明了引物和TaqMan探针的特异性。

主 题 词:实时荧光PCR 检测 瓜炭疽病菌 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 090402[090402] 

D O I:10.3969/j.issn.0529-1542.2016.02.023

馆 藏 号:203161235...

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