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江苏水稻黑条矮缩病病毒的RT-PCR分析和快速检测

江苏水稻黑条矮缩病病毒的RT-PCR分析和快速检测

作     者:杨杰 王军 周彤 陈志德 仲维功 YANG Jie;WANG Jun;ZHOU Tong;CHEN Zhi-de;ZHONG Wei-gong

作者机构:江苏省农业科学院粮食作物研究所江苏南京210014 江苏省农业科学院植物保护研究所江苏南京210014 

基  金:国家科技支撑计划重大项目(2006BADO2A03) 江苏省自然科学基金项目(BK2006159) 江苏省农业科技自主创新基金项目(CX603) 江苏省农业科学院基金项目(6110703 6510806) 

出 版 物:《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期:2008年第23卷第6期

页      码:87-92页

摘      要:为了明确江苏新发生的矮缩病害为水稻黑条矮缩病,采用RT-PCR和序列测定方法对其病原进行了精确鉴定。根据水稻黑条矮缩病病毒基因组序列的信息,设计扩增RNA聚合酶基因、外壳蛋白基因和RNA沉默抑制子基因以及核心蛋白基因部分编码区的4对引物,提取感染水稻黑条矮缩病病毒的水稻植株总RNA并进行RT-PCR扩增,可以在感病植株中分别扩增出水稻黑条矮缩病病毒基因组特有的4个条带,测序结果表明,来源于江苏南京的分离物的4个基因部分编码片段与已登录的对应基因片段核苷酸序列同源性达99%以上,共发现7个碱基的突变。经生物信息学分析发现7个单碱基突变都是同义突变,氨基酸序列没有改变。根据以上结果确认该病病原为水稻黑条矮缩病病毒。利用该方法可以对水稻和其他寄主进行早期病毒检测。

主 题 词:水稻黑条矮缩病 RT-PCR 病毒检测 

学科分类:09[农学] 0904[农学-动物医学类] 090401[090401] 

核心收录:

馆 藏 号:203163502...

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