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奶牛DRB3基因生物信息学分析

奶牛DRB3基因生物信息学分析

作     者:徐飞 成述儒 罗玉柱 XU Fei;CHENG Shu-ru;LUO Yu-zhu

作者机构:甘肃农业大学甘肃省草食动物生物技术重点实验室/动物科学技术学院兰州730070 

基  金:国家高技术研究发展计划("863"计划)项目(2006AA10Z196) 国家科技支撑计划项目(2007BAD52B05) 甘肃省农业生物技术专项(GNSW-2009-24) 甘肃省重点实验室建设计划项目(085RTSA004) 

出 版 物:《中国奶牛》 (China Dairy Cattle)

年 卷 期:2011年第2期

页      码:4-8页

摘      要:利用生物基因组学数据库,对奶牛MHCⅡ区DRB3基因进行生物信息学分析,以预测DRB3基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建DRB3同源基因的系统进化树。结果表明,DRB3编码产物为不稳定亲水性蛋白,具有明显的信号肽,其切割位点位于29~30位的氨基酸之间。二级结构主要以无规则卷曲和延伸链为主,主要在细胞质中发挥生物学作用。序列分析表明,DRB3编码产物可能具有免疫应答、受体、胁迫应答、信号转导等功能,可能在免疫应答和胁迫应答过程中发挥重要作用,可能对奶牛免疫力和抗病性起关键作用。DRB3编码产物氨基酸邻接系统树表明,奶牛DRB3与绵羊、羚羊、塔尔羊、麝牛、亚洲水牛等物种DRB3氨基酸距离较近,它们具有高度同源性。

主 题 词:主要组织相容性复合体 DRB3基因 生物信息学 奶牛 

学科分类:0905[农学-林学类] 09[农学] 

D O I:10.3969/j.issn.1004-4264.2011.02.002

馆 藏 号:203164457...

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