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兔豆状囊尾蚴TpRS1基因的克隆及其序列分析

兔豆状囊尾蚴TpRS1基因的克隆及其序列分析

作     者:韩乐乐 李作磊 苟惠天 孙晓林 Han Lele;Li Zuolei;Gou Huitian;Sun Xiaolin

作者机构:甘肃农业大学动物医学院兰州730070 

基  金:甘肃省农业生物技术研究与应用开发项目(GNSW-2010-01) 甘肃省科技支撑计划项目(1104NKCA082) 

出 版 物:《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期:2014年第30卷第7期

页      码:131-136页

摘      要:旨在研究兔豆状囊尾蚴TpRS1的功能,根据GenBank中猪带绦虫RS1 cDNA序列设计引物,以豆状囊尾蚴总RNA为模板,利用RT-PCR技术首次克隆到兔豆状囊尾蚴TpRS1的完整开放阅读框序列,并利用生物信息学软件对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构和抗原位点等方面进行了预测和分析。结果表明,兔豆状囊尾蚴TpRS1的cDNA序列为275 bp的基因片段,该序列含有一个由258个核苷酸组成的开放阅读框,编码85个氨基酸。其编码蛋白疏水性,分子质量为9.6 kD,理论等电点为9.07。TpRS1二级结构中α螺旋占70.59%,β折叠占5.88%,其余23.53%为无规卷曲,TpRS1没有信号肽序列,同源性分析表明与其他带科绦虫的一致性在72%以上,系统进化分析表明与泡状带绦虫处于同一进化分支。

主 题 词:豆状囊尾蚴 TpRS1基因 克隆 序列分析 

学科分类:090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D O I:10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2014.07.030

馆 藏 号:203166251...

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