A型产气荚膜梭菌青海分离株α毒素基因分析及其蛋白结构与抗原表位预测

作     者：冶贵生 马玉花 韩志辉 邹勇 贾跃宁 YE Gui-sheng;MA Yu-hua;HAN Zhi-hui;ZOU Yong;JIA Yue-ning

作者机构：青海大学农牧学院青海西宁810016 西北农林科技大学动物医学院陕西杨凌712100 

基　　金：国家自然科学基金项目(31160511) 青海省科技厅项目(2012-Z-930Q) 青海省外专局项目(H20126300013) 

出 版 物：《动物医学进展》 (Progress In Veterinary Medicine)

年 卷 期：2014年第35卷第8期

页      码：12-18页

摘      要：应用PCR技术对A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因进行扩增,并进行测序,利用生物软件对α毒素基因序列进行分析,对蛋白结构、B细胞抗原表位进行预测。结果表明,A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因长度为1 110bp,编码370个氨基酸。与参考菌株T0、S16、NRRLB-23744、KZ211和CER89L1216的α毒素基因核苷酸序列同源性依次为99.9%、99.9%、99.9%、99.9%和99.7%,氨基酸序列同源性均为100%。综合α毒素蛋白亲水性、表面可能性、抗原指数及二级结构预测结果显示在26-29、71-78、111-114、182-185、189-192、264-268、272-275、282-285、294-297、362-365位氨基酸残基存在可能的B细胞抗原表位,结合三级结构预测结果显示,α毒素294位-297位氨基酸残基形成表位并结合抗体的可能性较高。研究结果可为A型产气荚膜梭菌表位疫苗的设计与研制提供基础。

主 题 词：A型产气荚膜梭菌 α毒素 序列分析 表位 蛋白结构 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1007-5038.2014.08.004

馆 藏 号：203166285...