人血白蛋白结合位点II的分子结合模式研究

作     者：徐诗文 林东强 姚善泾 XU Shi-Wen;LIN Dong-Qiang;YAO Shan-Jing

作者机构：浙江大学化学工程与生物工程学院生物质化工教育部重点实验室杭州310027 

基　　金：国家自然科学基金(21476198 21276228 21576233)资助项目 

出 版 物：《物理化学学报》 (Acta Physico-Chimica Sinica)

年 卷 期：2016年第32卷第7期

页      码：1819-1828页

摘      要：人血白蛋白是血浆中含量最高的蛋白,是一种重要的载体蛋白,能与多种内源性和外源性物质结合。人血白蛋白主要有两个药物结合位点,位点I和位点II,其中位点II的柔性较大,对药物分子的亲和性较高。本文采用分子模拟方法,基于12种结合于位点II的小分子-人血白蛋白晶体结构,分析了相互作用能,发现12种分子的结合以疏水作用为主,静电作用为辅。进一步采用丙氨酸扫描和结合能评价,分析结合部位的关键氨基酸残基,探究结合模式的规律性,发现从位点入口到空腔内部存在静电、疏水和杂合的三层相互作用分布,共同形成了稳定的分子结合。最后采用分子对接和分子动力学模拟,预测了L-色氨酸的结合模式。研究结果有助于深入了解人血白蛋白药物位点II的小分子结合模式,为基于位点II的药物和分离配基的优化设计提供指导。

主 题 词：人血白蛋白 位点II 分子对接 分子动力学 结合模式 

学科分类：1001[医学-基础医学] 10[医学] 

核心收录：

D　O　I：10.3866/pku.whxb201604151

馆 藏 号：203166771...