三元统计语言模型对基因表达载体设计的优化

作     者：方刚 张社民 FANG Gang;ZHANG Shemin

作者机构：西安文理学院生物与环境工程学院西安710065 西安财经学院信息学院西安710100 

基　　金：国家自然科学基金(No.61173113) 

出 版 物：《计算机工程与应用》 (Computer Engineering and Applications)

年 卷 期：2016年第52卷第15期

页      码：60-64,140页

摘      要：不断地将一些合成生物学标准"零件"以一定的标准装配,就可以得到由数十个功能片段组成的复杂表达载体。但是每一类的合成生物学标准"零件"数量众多,随着这些标准"零件"的不断开发,其数量也在进一步增加。在进行表达载体构建的最后阶段,从众多的"零件"中选择合适的以组装成功能性表达载体费时费力,并且容易发生错误。为解决这一问题,采用了自然语言处理的统计语言模型,并以该模型为基础应用动态规划算法优化表达载体设计,从众多的选项中找出最优者。利用这一方法可以减少进行生物学实验的冗余操作,从而减少表达载体构建过程中的花费。

主 题 词：合成生物学 统计语言模型 动态规划算法 合成生物学标准“零件” 

学科分类：081203[081203] 08[工学] 0835[0835] 0812[工学-测绘类] 

D　O　I：10.3778/j.issn.1002-8331.1604-0019

馆 藏 号：203167214...