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基于cox1和D-loop区序列雷州半岛红树林海区2种野生弹涂鱼的遗传变异

基于cox1和D-loop区序列雷州半岛红树林海区2种野生弹涂鱼的遗传变异

作     者:廖健 贺亮 张顺 沈自慧 黄永胜 龙水生 黄承勤 王中铎 LIAO Jian;HE Liang;ZHANG Shun;SHEN Zi-hui;HUANG Yong-sheng;LONG Shui-sheng;HUANG Cheng-qin;WANG Zhong-duo

作者机构:广东海洋大学水产学院南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室广东湛江524025 

基  金:广东海洋大学"海之帆-起航计划"大学生科技创新项目(hzfqhjhkjfm2015b11) 广东海洋大学优秀学位论文培育项目(201605) 国家自然科学基金项目(31201996) 

出 版 物:《广东海洋大学学报》 (Journal of Guangdong Ocean University)

年 卷 期:2016年第36卷第4期

页      码:6-11页

摘      要:设计双层洞穴式弹涂鱼捕捉器,于雷州半岛红树林海区捕获弹涂鱼类野生群体,筛选出弹涂鱼(Periophthalmus modestus)、大弹涂鱼(Boleophthalmus pectinirostris)2个优势种群,并获取其线粒体控制区(D-loop)和cox 1基因部分序列,进行序列变异分析及遗传分析。结果表明,cox 1基因和D-loop区碱基组成A+T含量均大于C+G。cox 1数据揭示,大弹涂鱼变异位点占总长度2.1%,弹涂鱼占2.4%,种内平均遗传距离分别为0.003、0.006,种间遗传距离为0.158,37个个体共定义22个单倍型,单倍型多样性为0.950 45。而D-loop区数据指明,大弹涂鱼变异位点占总长度4.9%,弹涂鱼占7.5%,种内平均遗传距离分别为0.012、0.019,种间距离为0.409,37个个体定义32个单倍型,单倍型多样性水平极高(0.989 49)。中性检验结果显示,2种弹涂鱼进化历程符合中性进化假设,且存在群体扩张的可能。综合cox 1基因和控制区数据显示:弹涂鱼种群遗传多样性高于大弹涂鱼。

主 题 词:红树林 弹涂鱼 捕捉器 序列变异 系统进化 

学科分类:0908[0908] 09[农学] 

D O I:10.3969/j.issn.1673-9159.2016.04.002

馆 藏 号:203167434...

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