基于新型淬灭剂建立荧光PCR甄别幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因突变的方法

作     者：陈志勇 罗芸 黄忱 叶菊莲 应晟 李辉 金大智 CHEN Zhi-yong;LUO Yun;HUANG Chen;YE Ju-lian;YING Shen;LI Hui;JIN Da-zhi

作者机构：奉化市人民医院浙江奉化315500 浙江省疾病预防控制中心 上海辉睿生物科技有限公司 

基　　金：浙江省自然科学基金资助项目(LY13B020003) "艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治科技重大专项"课题(2013ZX10004103) 

出 版 物：《预防医学》 (CHINA PREVENTIVE MEDICINE JOURNAL)

年 卷 期：2016年第28卷第7期

页      码：666-670页

摘      要：目的采用新型淬灭剂结合荧光PCR检测幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因突变的检测方法。方法根据幽门螺杆菌23S r DNA第2142和2143两个基因多态性位点设计引物和标记新型荧光淬灭剂的探针;提取幽门螺杆菌菌体总DNA,采用实时荧光定量PCR方法对收集的55株幽门螺杆菌临床分离株进行检测,同时与Taq Man探针和直接测序方法结果进行比对,进一步评价其临床实用性。结果本试验建立的方法能特异性地甄别23S r DNA第2142和2143位点的基因多态性,除对应位点的探针出现荧光信号外,其他探针均为阴性。该方法的变异系数小于5%,样本灵敏度可达到1 copy/反应。对收集的55株幽门螺杆菌临床分离株进行检测,检测到AA型菌株36株(65.45%)、AG型菌株15株(27.27%)和GA型菌株4株(7.27%),与Taq Man探针及直接测序结果均一致。结论本试验所建立的方法能有效甄别幽门螺杆菌克拉霉素耐药基因突变位点A2142G和A2143G。

主 题 词：新型淬灭剂 幽门螺杆菌 荧光PCR 克拉霉素耐药基因 检测 

学科分类：1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D　O　I：10.19485/j.cnki.issn1007-0931.2016.07.005

馆 藏 号：203167649...