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含内参的登革病毒与基孔肯雅病毒3重荧光定量PCR检测方法的建立与评估

含内参的登革病毒与基孔肯雅病毒3重荧光定量PCR检测方法的建立与评估

作     者:徐静 谢翊 管大伟 苏健平 廖华乐 柯昌文 XU Jing;XIE Yi;GUAN Da-wei;SU Jian-ping;LIAO Hua-le;KE Chang-wen

作者机构:南方医科大学公共卫生与热带医学学院广东广州510515 广东省疾病预防控制中心广东广州511430 佛山市疾病预防控制中心广东佛山528000 上海之江生物科技股份有限公司上海200000 

基  金:实验室感染性材料溯源和生物风险溯源关键技术和产品研究项目(No.2014AA021404) 

出 版 物:《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期:2016年第11卷第4期

页      码:301-304,311页

摘      要:目的建立一种含内参的,针对登革病毒和基孔肯雅病毒核酸检测的3重荧光定量PCR方法。方法针对登革病毒3 端非结构蛋白编码区和基孔肯雅病毒5 端非结构蛋白编码区设计引物与探针,建立一套含有内参的并且能同时检测登革病毒和基孔肯雅病毒的3重实时荧光定量RT-PCR方法。对其最低检测限和特异度进行验证,通过检测血清标本对该方法进行临床应用评估。结果建立的3重荧光定量PCR登革病毒与基孔肯雅病毒绝对定量标准曲线显示,病毒拷贝数的对数值与CT值之间具有良好的线性关系,梯度稀释后的标准品核酸检测均呈现典型的S型曲线。检测日本脑炎病毒、西尼罗病毒、黄热病毒、辛德毕斯病毒各1株,结果均为阴性,特异度为100%。用该方法检测294份登革热患者血清,灵敏度为100%,特异度为89.3%,阳性预测值为92.1%,阴性预测值为100%;测定33份基孔肯雅热病患者血清的灵敏度、特异度及阴、阳性预测值均为100%。结论建立的含有内参的能同时检测登革病毒与基孔肯雅病毒的3重荧光定量PCR方法具有较高的灵敏度和特异度,可用于登革病毒与基孔肯雅病毒感染检测,为早期筛查和鉴别登革病毒和基孔肯雅病毒感染提供依据。

主 题 词:3重荧光定量RT-PCR 登革病毒 基孔肯雅病毒 

学科分类:1007[医学-药学类] 100705[100705] 1001[医学-基础医学] 100103[100103] 10[医学] 

D O I:10.13350/j.cjpb.160403

馆 藏 号:203168310...

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