利用CODEHOP克隆意蜂Hsp90基因及生物信息分析

作     者：朱世馨 耿昕颖 王家祯 董文龙 贾小营 马红霞 高云航 ZHU Shi-xin;GENG Xin-ying;WANG Jia-zhen;DONG Wen-long;JIA Xiao-ying;MA Hong-xia;GAO Yun-hang

作者机构：吉林农业大学动物科学技术学院长春130118 

基　　金：吉林省科技发展计划项目(20111820) 

出 版 物：《上海交通大学学报（农业科学版）》 (Journal of Shanghai Jiaotong University(Agricultural Science))

年 卷 期：2016年第34卷第3期

页      码：28-34页

摘      要：Hsp90(heat shock protein 90)是热休克蛋白家族中重要成员,在蜜蜂多种生理调控、应激及免疫反应中起到重要作用。本研究利用CODEHOP(consensus-degenerate hybrid oligonucleotide primers)法通过特定氨基酸序列设计简并引物首次克隆纯系意大利蜜蜂(Apis mellifera Ligustica Spin)Hsp90基因序列,对其进行生物信息学分析并构建系统进化树。结果表明蜜蜂Hsp90基因在进化中比较保守,经过比对意蜂与西方蜜蜂DNA序列同源性为99%;与大蜜蜂、小蜜蜂和熊蜂同源性分别为97%、97%和90%,该DNA片段编码一个由320个氨基酸组成的肽段,种属间氨基酸差异率为30%,氨基酸替代率在0.01到3.28之间。利用该方法设计简并引物,简并度低,特异性强,为蜜蜂未知功能基因克隆提供了便捷有效途径,开展Hsp90基因功能研究在遗传变异及种质资源保护中具有重要的意义。

主 题 词：意大利蜜蜂 简并引物 热休克蛋白90 

学科分类：090504[090504] 0905[农学-林学类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/J.ISSN.1671-9964.2016.03.005

馆 藏 号：203170076...