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日本血吸虫真核生物翻译起始因子2α亚基全长cDNA的克隆与功能分析

日本血吸虫真核生物翻译起始因子2α亚基全长cDNA的克隆与功能分析

作     者:卢晓昭 彭鸿娟 陈晓光 

作者机构:第一军医大学寄生虫学教研室广东广州510515 

基  金:联合国发展计划署/世界银行/世界卫生组织热带病研究和培训特别规划署基金(A00690 A00191) 

出 版 物:《第一军医大学学报》 (Journal of First Military Medical University)

年 卷 期:2003年第23卷第4期

页      码:296-299页

摘      要:目的对用表达序列标签(EST)策略从日本血吸虫(Schistosomajaponicum)尾蚴cDNA文库中筛选出的新基因进行全长cDNA克隆及功能预测。方法将插入于pTriplEx2 质粒上的cDNA进行测序,测序结果经BLASTn程序搜索,发现该插入cDNA序列与曼氏血吸虫真核生物翻译起始因子2α亚基(eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit, eIF2α) 基因高度同源。根据该EST序列设计与pTriplEx2 质粒上的5 端测序引物相匹配的PCR下游引物,从该cDNA文库中扩出包含eIF2α全长ORF的cDNA片段。将PCR产物纯化后克隆到pGEM-T载体上,并对此克隆进行测序得到其全长cDNA序列。用NCBI 站点的BLASTx及BLASTn程序对所获得的新基因序列进行同源性搜索;用blast two sequence程序对同源性高的基因进行核苷酸及氨基酸水平的同源性比较。同时用网上分析软件进行基序和保守区域的搜索。结果发现一个与曼氏血吸虫eIF2α亚基mRNA高度同源的日本血吸虫新基因,核苷酸与氨基酸水平的同一性分别为87%和79%,编码由327个氨基酸组成的蛋白序列。结论用EST策略筛选到一个日本血吸虫新基因,编码eIF2α亚基,全长编码序列与曼氏血吸虫eIF2α亚基mRNA高度同源。

主 题 词:日本血吸虫 表达序列标签 基因克隆 真核生物翻译起始因子2α 

学科分类:1001[医学-基础医学] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3321/j.issn:1673-4254.2003.04.003

馆 藏 号:203171071...

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