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巨魾线粒体DNA ND6基因克隆及多态性分析

巨魾线粒体DNA ND6基因克隆及多态性分析

作     者:牛宝珍 杜民 刘艳红 白莉 艾家灵 

作者机构:红河学院生命科学与技术学院/云南省高校农作物优质高效栽培与安全控制重点实验室云南蒙自661199 

基  金:国家自然科学基金(编号:31360638) 云南省中青年学术带头人后备人才项目(编号:2015HB059) 云南省教育厅科学研究基金重大专项(编号:ZD2013009) 红河学院中青年学术带头人后备人才项目(编号:2014HB0203) 红河学院博士专项(编号:14bs11) 

出 版 物:《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期:2016年第44卷第4期

页      码:62-65页

摘      要:利用GenBank数据库中鮡魾科鱼线粒体ND6基因序列保守区设计引物,采用PCR技术克隆并测序,共得到12尾巨魾ND6基因全序列。用DNAMAN 5.0软件比对序列,MEGA 5.0软件分析科不同鱼类的进化关系,结果表明:巨魾ND6基因序列全长为516 bp,碱基含量分别为14.20%、34.50%、40.20%、11.00%,其中"A+T"含量(54.40%)高于"G+C"含量(45.50%),存在4个单倍型,发生3次颠换;12个个体4个单倍型间的平均相对遗传距离为0.003;将巨魾与其他14种鱼类的ND6基因用Neighbore-Joining(NJ)法构建系统发育树,发现巨魾单独聚为1支。研究将为今后鱼类线粒体基因组的研究提供科学依据。

主 题 词:巨魾 线粒体 ND6基因 多态性 系统进化 

学科分类:0908[0908] 09[农学] 

D O I:10.15889/j.issn.1002-1302.2016.04.016

馆 藏 号:203172062...

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