苦楝丛枝植原体相关膜蛋白基因分析及结构预测

作     者：吴德喜 袁恩平 王连春 蔡红 陈海如 WU De-xi;YUAN En-ping;WANG Lian-chun;CAI Hong;CHEN Hai-ru

作者机构：云南农业大学云南省植物病理重点实验室云南昆明650201 

基　　金：国家自然科学基金(31060239) 云南省科技创新人才计划项目(2011HB026) 

出 版 物：《云南农业大学学报（自然科学版）》 (Journal of Yunnan Agricultural University:Natural Science)

年 卷 期：2013年第28卷第3期

页      码：310-316页

摘      要：根据植原体编码蛋白转运系统SecY亚基以及抗原膜蛋白amp基因的保守序列分别设计引物,并采用PCR对采自云南文山的苦楝丛枝感病植株总DNA进行扩增、产物克隆及序列测定。结果显示扩增的SecY亚基DNA片段长1 354 bp,编码一个包含414个氨基酸的SecY蛋白,序列同源性显示该片段与"***-ma asteris"(16SrI组)中的株系最高,达94%～99%;构建16SrI组内基于secY序列的系统进化树,认为该株系为secY(I)-O亚组。扩增的免疫膜蛋白DNA片段长1 176 bp,编码1个包含233个氨基酸的免疫膜蛋白(Amp)。蛋白结构预测显示secY亚基蛋白是一个有9个跨膜区的整合跨膜蛋白,而Amp蛋白是一类两端具有明显跨膜区,且N-端有多肽切割位点的Ⅲ型膜蛋白。

主 题 词：苦楝丛枝植原体 膜蛋白 secY amp 结构预测 

学科分类：07[理学] 0713[0713] 

D　O　I：10.3969/j.issn.1004-390X(n).2013.03.005

馆 藏 号：203173285...