桉树人工林根际土壤DNA提取的优化

作     者：胡凯 愈霞 王微 HU Kai;YU Xia;WANG Wei

作者机构：重庆文理学院林学与生命科学学院重庆402168 

基　　金：重庆市教委科学技术研究项目(KJ131201) 重庆市自然科学基金项目(cstc2013jcyj A20019) 重庆文理学院校级科研项目(Y2011SK42) 

出 版 物：《湖北农业科学》 (Hubei Agricultural Sciences)

年 卷 期：2016年第55卷第12期

页      码：3207-3211页

摘      要：通过优化土壤微生物总DNA的提取方法,获得高纯度、高得率和完整性好的总DNA,为桉树种植地土壤微生物群落多样性的分析奠定基础。综合比较已报道的土壤微生物DNA提取方法的优缺点,设计了7种从巨桉(Eucalyptus grandis Hill ex Maiden)人工林根际土壤中直接提取微生物DNA的方法,并通过PCR扩增、DGGE电泳及荧光定量PCR分析比较了不同方法所提取DNA的质量以及对后期分子生物学研究的适用性。结果表明,使用PVPP和硫酸铝铵联用吸附腐殖酸杂质后,采用PEG 8 000沉淀能够有效地提取桉树根际土壤DNA。该方法提取的DNA纯度最高,OD260 nm/OD230 nm达到2.45,OD260 nm/OD280 nm达到1.78,DNA得率为5.56μg/g土壤,适用于PCR扩增和荧光定量分析,并且通过DGGE电泳分离出最丰富的条带,是一种高效的提取土壤微生物DNA方法。

主 题 词：桉树(Eucalyptus)人工林 根际 土壤 DNA提取 PCR扩增 

学科分类：0710[理学-生物科学类] 1007[医学-药学类] 100705[100705] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[071007] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 071005[071005] 090102[090102] 10[医学] 

D　O　I：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.12.053

馆 藏 号：203177349...