代谢网络流分析方法概述

作     者：庞建 刘占英 郝敏 PANG Jian;LIU Zhan-ying;HAO Min

作者机构：内蒙古工业大学化工学院呼和浩特010051 内蒙古工业大学煤炭转化与循环经济研究所呼和浩特010051 

基　　金：国家自然科学基金(61361016) 教育部高等学校博士学科点专项科研基金(2013151412000) 内蒙古自治区草原英才工程 内蒙古自治区高等学校青年科技英才支持计划资助 中国科学院"西部之光"人才培养计划资助 内蒙古自治区人才开发基金 内蒙古自然科学基金(2013MS0511) 内蒙古人社厅留学人员科技活动项目 内蒙古科技攻关项目 兰州重离子加速器国家实验室开放课题 

出 版 物：《生物学杂志》 (Journal of Biology)

年 卷 期：2016年第33卷第4期

页      码：97-102页

摘      要：生物体代谢网络模型是系统生物学的重要研究内容之一,代谢网络流分析方法在代谢网络分析中具有重要意义。了解代谢网络流量分析方法有助于理解代谢网络结构和功能的关系,代谢流量与基因表达的关系,在分析疾病,识别药物靶标,制药工程和基因改造方面具有重要现实意义。综述了几种常用代谢网络流分析方法:流平衡分析(FBA)、代谢调节最小化分析(MOMA)、调节开关最小化分析(ROOM)、含有二次线性规划的动态流平衡分析方法(DFBA-LQR)、流量范围分析(FVA)、双层规划策略识别基因敲除(Opt Knock)、基因表达上调下调(OptReg)和重新设计生产系统的计算框架(Opt Strain)等,以期为代谢网络流分析提供参考,并进一步为实验研究提供指导。

主 题 词：代谢网络 系统生物学 流分析方法 

学科分类：090502[090502] 0905[农学-林学类] 09[农学] 

D　O　I：10.3969/j.issn.2095-1736.2016.04.097

馆 藏 号：203181977...