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蛋白质结构限制性对HIV-1耐药相关基因分子进化规律的影响研究

蛋白质结构限制性对HIV-1耐药相关基因分子进化规律的影响研究

作     者:关琪 韩晓旭 赵彬 张旻 沈书旭 王亚男 姜拥军 耿文清 尚红 Guan Qi;Han Xiaoxu;Zhao Bin;Zhang Min;Shen Shuxu;Wang Yanan;Jiang Yongjun;Geng Wenqing;Shang Hong

作者机构:中国医科大学附属第一医院国家卫生和计划生育委员会艾滋病免疫学重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心 110024沈阳医学院附属中心医院中心实验室检验科沈阳市第一人民医院检验科沈阳110001 中国医科大学附属第一医院国家卫生和计划生育委员会艾滋病免疫学重点实验室感染性疾病诊治协同创新中心沈阳110001 

基  金:国家“十二五”重大专项(2012ZX10001-006) 国家自然科学基金(81171619) 辽宁省自然科学基金(2013020210) 沈阳市科技计划项目(F16-206-9-15) 

出 版 物:《中华微生物学和免疫学杂志》 (Chinese Journal of Microbiology and Immunology)

年 卷 期:2016年第36卷第6期

页      码:401-407页

摘      要:目的:通过对65名HIV治疗队列中发生耐药的感染者进行较系统的前瞻性队列研究,阐明我国抗病毒治疗过程中,HIV RT蛋白耐药进化的结构限制性以及HIV耐药的发生规律。方法从2003年开始,每半年1次,连续4年对队列感染者进行随访采集静脉血样,提取病毒RNA后对RT基因进行RT-PCR扩增和测序。将所获得的序列进行系统进化、耐药位点变异和蛋白质结构分析。结果 RT酶中大部分的氨基酸位点都是保守的,而序列的变异仅发生在12.44%的位点之上。非核苷类逆转录酶抑制剂( NNRTI)高水平耐药位点多位于RT蛋白的内部,而中等水平耐药位点多位于蛋白质的表面。核苷类逆转录酶抑制剂( NRTI)高水平耐药位点均位于RT蛋白的表面,而低水平耐药位点均位于RT蛋白的内部。结论 NNRTI和NRTI类耐药突变位点在RT蛋白中截然相反的分布特征,可以为针对RT靶点的抗病毒药物的设计和开发起到一定的指导作用。

主 题 词:人类免疫缺陷病毒1型 选择压力 适宜性 结构限制 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 1004[医学-公共卫生预防医学类] 1002[医学-临床医学类] 1001[医学-基础医学] 100401[100401] 10[医学] 

核心收录:

D O I:10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2016.06.001

馆 藏 号:203186385...

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