猪流行性腹泻病毒湖北株的分离鉴定及其s1基因进化分析

作     者：桂锐 郭锐 田永祥 李文浩 蔡行 段正赢 杨克礼 刘泽文 袁芳艳 刘威 邢崔昱 周丹娜 

作者机构：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所/动物胚胎工程及分子育种湖北省重点实验室武汉430064 华中农业大学动物医学院武汉430070 

基　　金：中国农业科学院哈尔滨兽医生物技术国家重点实验室开放基金项目(SKLVBF201513) 湖北省自然科学基金重点项目(2014CFA106) 湖北省农业科学院青年基金项目(2014NKYJJ09) 湖北省科技支撑计划(公益性课题)项目(2014BBB010) 湖北省农业科技创新中心项目(2011-620-001-003) 

出 版 物：《湖北农业科学》 (Hubei Agricultural Sciences)

年 卷 期：2016年第55卷第6期

页      码：1506-1510页

摘      要：猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV）是猪的肠道传染病病原,主要引起仔猪呕吐、腹泻和脱水,对一周龄内的哺乳仔猪危害最为严重,死亡率可达50%～100%。利用Vero86细胞从湖北某猪场腹泻仔猪小肠病料中分离到一株病毒,经RT-PCR检测、序列比对后确定其为PEDV,命名为HB201503株。设计PEDV s1基因的全长扩增引物,获得该株病毒的s1基因全长序列并进行了进化分析,结果表明该毒株与近年来在Gen Bank登陆的PEDV s1基因核苷酸序列相似性在91.4%～99.2%,与疫苗株CV777相似性较低,仅为91.8%。通过s1基因进化树分析表明HB201503以及近几年国内分离毒株主要集中在第I个亚群,且HB201503株与KM406183（2014,四川）和KM609206（2015,江苏）同源性较高。此外,s1蛋白氨基酸序列比对显示,HB201503与近几年分离毒株及疫苗株CV777均在55-74、157-163位氨基酸出现了连续4个以上氨基酸的缺失或替换,而且HB201503株与CV777及近几年分离毒株相比,还在270-283位氨基酸上出现了1个氨基酸的缺失和10个氨基酸的替换。

主 题 词：猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV) 分离鉴定 s1基因 进化分析 

学科分类：090601[090601] 09[农学] 0906[农学-水产类] 

D　O　I：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.06.036

馆 藏 号：203186823...