小麦和水稻auxin基因家族的生物信息学比较分析

作     者：张俊红 孟成生 张彩英 史峥 王笑颖 李爱丽 马峙英 ZHANG Jun-hong;MENG Cheng-sheng;ZHANG Cai-ying;SHI Zheng;WANG Xiao-ying;LI Ai-li;MA Zhi-ying

作者机构：河北农业大学河北省作物种质资源重点实验室河北保定071001 中国农业科学院作物科学研究所农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室北京100081 

基　　金：国家“973”计划项目(222092) 

出 版 物：《华北农学报》 (Acta Agriculturae Boreali-Sinica)

年 卷 期：2009年第24卷第6期

页      码：15-19页

摘      要：根据测序获得的1条260 bp cDNA片段,通过预测发现其包含小麦植物生长素(AUXIN)基因的部分编码序列,通过电子延伸、设计引物,从小麦Mardler/7*百农3217的cDNA中扩增获得一条608 bp的cDNA片段,该基因序列数据库(GenBank)登录号为AY902381(基因)和(蛋白)。编码202个氨基酸,预计蛋白的分子量为23.0 kDa,等电点为9.93。利用已经分离的小麦生长素(AUXIN)基因的保守序列为检索序列,对小麦和水稻中的AUXIN基因家族成员进行分析,利用这些基因编码蛋白序列构建系统发生树,查找在GenBank的EST数据库中查找这些基因的ESTs表达序列,分析了这些基因在细胞中的定位情况和蛋白结构的相似性,根据已知相似基因的功能,分析该基因有进一步深入研究的必要。

主 题 词：小麦 水稻 植物生长素 

学科分类：08[工学] 09[农学] 0901[农学-植物生产类] 0836[0836] 090102[090102] 

核心收录：

馆 藏 号：203186858...