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基于相对熵的蛋白质设计新方法

基于相对熵的蛋白质设计新方法

作     者:刘贇 王宝翰 王存新 陈慰祖 

作者机构:北京工业大学生命科学与生物工程学院北京100022 中国科学院生物物理研究所北京100101 

基  金:国家自然科学基金(批准号:10174005 30170230) 北京市自然科学基金(批准号:5032002 

出 版 物:《中国科学(G辑)》 (SCIENCE IN CHINA(SERIES G))

年 卷 期:2003年第33卷第4期

页      码:348-356页

摘      要:提出一个关于蛋白质设计的新的有效快速的优化方法,其实质是按照Boltz-mann分布搜索序列空间。这一方法完全基于物理学原理,在该方法中使用了相对熵的概念,并把它作为优化的目标函数。利用真实蛋白质的非格子模型对该方法进行了检验。与同类工作相比,得到了较好的结果。该方法可以作为处理蛋白质折叠和逆折叠的统一框架。

主 题 词:蛋白质设计 相对熵 非格子模型 Boltzmann分布搜索序列空间 蛋白质逆折叠 优化方法 

学科分类:0710[理学-生物科学类] 071010[071010] 081704[081704] 07[理学] 08[工学] 0817[工学-轻工类] 

核心收录:

D O I:10.3969/j.issn.1674-7275.2003.04.006

馆 藏 号:203187080...

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